Tipps für die Illustration biologischer Signalwege

Übersicht

Willkommen bei den Design-Tipps für Industrie-Wissenschaftler im BioRender Learning Hub. Heute konzentrieren wir uns auf die Illustration biologischer Signalwege – eine ganz besondere Art von Abbildung, vor deren Erstellung viele von uns zurückschrecken. Und das zu Recht, denn sie sind oft recht kompliziert zu erstellen. Wir haben das Thema jedoch in allgemeine Konzepte und Design-Tipps unterteilt, damit Ihnen die nächste Illustration hoffentlich leichter von der Hand geht.

Für diejenigen, die BioRender noch nie benutzt haben: Es scheint, als wären einige neue Gesichter dabei oder Personen, die die App noch nicht ausprobiert oder sich noch nicht angemeldet haben. Es ist ein sehr einfach zu bedienendes Drag-and-Drop-Illustrationswerkzeug. Alles, was Sie brauchen, befindet sich hoffentlich in der Bibliothek und ist bereit, per Drag-and-Drop auf die Arbeitsfläche gezogen zu werden, damit Sie biologische Signalwege, Protokolle, Zeitpläne, Zell-Zell-Interaktionen und all diese Dinge erstellen können, um Ihre Wissenschaft zu kommunizieren.

Natürlich gehören zu den häufigsten Anwendungsfällen für BioRender in erster Linie Präsentationen – viele von Ihnen, die in der Industrie arbeiten, werden das kennen. Natürlich auch Publikationen, Förderanträge, Vorschläge, Poster – falls ich eines Tages dazu zurückkehre –, experimentelle Abläufe und sogar die Kommunikation mit Laien. Ich weiß, dass Abbildungen für Laienzusammenfassungen immer beliebter werden. Sie möchten Ihre Wissenschaft der breiten Öffentlichkeit vermitteln können, und Abbildungen sind natürlich ein hervorragender Weg dafür.

Fangen wir also an. Wir haben eine Menge Tipps zusammengetragen, die auf unserer über zehnjährigen Erfahrung in der Erstellung von Signalwegen, intrazellulären Mechanismen und Wirkungsweisen basieren. Hoffentlich können Sie das, was wir Ihnen heute zeigen, in Ihrer nächsten Abbildung umsetzen.

Der Grund, warum biologische Signalwege oder Signalwegdiagramme so komplex und einschüchternd sind, liegt darin, dass wir an diese Art von Bildern gewöhnt sind. Natürlich dienen sie je nach Komplexitätsgrad und Verwendungszweck unterschiedlichen Zwecken, aber im Allgemeinen laufen sie auf viele Kreise mit Wörtern darin und sich kreuzende Pfeile hinaus. Sie sind einschüchternd zu zeichnen und auch für den Betrachter schwer zu erfassen.

Das ist wahrscheinlich das, was Sie kennen. Hier ist ein weiteres Beispiel für eine Art Signalwegdiagramm, und es gibt definitiv einen Grund, warum es so komplex wird. Die Natur selbst ist natürlich sehr, sehr komplex, viel komplexer als das, was hier gezeigt wird, und das ist auch nicht das, was man mit bloßem Auge sehen würde, wenn man in diesem Maßstab schauen würde. Es findet also viel Abstraktion statt, und wir nehmen uns viel künstlerische Freiheit, wenn wir Strukturen, Einheiten und Signalwege darstellen. Es liegt an uns, dies sehr klar, prägnant und auch auf standardisierte Weise zu kommunizieren.

Natürlich gibt es auch diese Art von Bildern, die fast wie ein Poster wirken. Ich habe sie oft gesehen, wenn ich in ein Labor gehe; viele von Ihnen haben sie vielleicht fast als Dekoration an der Wand. Sie dienen nicht unbedingt einem Zweck für die Veröffentlichung in einem Paper, aber vielleicht werden sie markiert oder gespeichert, wenn man wie in einer Enzyklopädie darauf zurückgreifen möchte, oder sie sind in ihrer Darstellung etwas künstlerischer. Ich vergleiche das mit einer Landkarte oder eher einer künstlerischen Karte. Das hier sind die Weinregionen Frankreichs. Ich habe das aus dem Internet, aber es ist sehr schön, eine coole Sache zum Ausdrucken und an die Wand hängen. Aber ich vermute, wenn Sie in Südfrankreich sind, möchten Sie eher ein richtungsweisendes Bild wie dieses hier – wie man von Punkt A nach Punkt B kommt –, weniger eine Darstellung aller möglichen Informationen in der schönsten, dekorativsten Form.

Ich denke also gerne so über den Aufbau von Signalwegdiagrammen oder eigentlich jeder wissenschaftlichen Abbildung nach: Weglassen, was man nicht zeigen muss, und sich auf das konzentrieren, was man zeigen muss oder was wichtig ist – was ist ein „Nice-to-have“ im Vergleich zu dem, was unbedingt nötig ist? Manchmal müssen wir diese Opfer bringen, indem wir die Geschichte reduzieren, um zu zeigen, was notwendig ist und was nicht.

Damit haben wir unsere Erkenntnisse für heute in vier Tipps zusammengefasst, einfach aus Zeitgründen und natürlich im Hinblick darauf, wie viele Informationen man in einer Zoom-Sitzung aufnehmen kann. Wir haben es auf diese vier Konzepte reduziert. Erstens: Optimierung des Informationsflusses. Das gilt eigentlich für jede Art von Abbildung; selbst wenn Sie keine biologischen Signalwege erstellen, lässt sich dies definitiv auf jede Art von wissenschaftlicher Abbildung anwenden. Zweitens: Das Thema Farbe. Das ist kein wirklicher Tipp, sondern eher ein allgemeines Konzept: der richtige Einsatz von Sättigung und Kontrast, was sich nicht nur auf die Lesbarkeit auswirkt, sondern auch darauf, alle Arten von Nutzern zu bedienen, einschließlich farbenblinder Menschen. Drittens: Hineinzoomen, um den korrekten Maßstab zu zeigen. Es gibt hier ein paar Tricks, mit denen Sie den Betrachter orientieren können, damit er nicht ständig zwischen der Makro-Ebene des Organismus, der Zelle, dem Gewebe und den Proteinen hin- und herzoomen muss. Es gibt eine Möglichkeit, das etwas prägnanter darzustellen. Und viertens: der richtige Einsatz von Linien und Pfeilen, wie Sie gesehen und erlebt haben.

Biologische Signalwege basieren auf der spezifischen Anordnung grundlegender Elemente wie Quadrate, Formen, Pfeile und Linien. Es gibt einige allgemeine Regeln, die Ihnen helfen, Ihre Abbildung übersichtlicher und weniger chaotisch zu gestalten. Die Optimierung des Informationsflusses ist unabhängig von der Art der Abbildung wichtig. Es gibt einige grundlegende Informationsflüsse oder Kompositionen, an die man sich halten sollte, wie z. B. unidirektional von links nach rechts, von oben nach unten oder zyklisch. Vermeiden Sie Richtungswechsel. Das Prinzip der Nähe ist ebenfalls wichtig für Signalwege. Wenn Sie Konzepte zusammenstellen, sollten diese auf der Arbeitsfläche so einfach zu verschieben sein, als wären sie auf einem Haftnotizzettel notiert. Gruppieren Sie Elemente, die sich auf dasselbe Konzept beziehen, eng beieinander und achten Sie auf einen einheitlichen Abstand zwischen ihnen. Hier ist ein Beispiel dafür, wie Sie Elemente auf einer Seite besser ausrichten können, insbesondere bei Abbildungen mit mehreren Teilbereichen. Zeichnen Sie einen Rahmen um jeden Schritt und ordnen Sie sie so an, dass sie korrekt ausgerichtet sind und die Abstände zwischen ihnen konsistent sind.

Während eines User-Research-Gesprächs wurden verschiedene Themen und Methoden erörtert, wie etwa die Auswertung von Nutzerfeedback und die Zusammenstellung von User-Research-Methoden in einem Dokument. Die Bedeutung des Verständnisses von Nutzerbedürfnissen wurde ebenfalls diskutiert, und ein Folgetermin wurde vereinbart, um das Nutzerfeedback weiter zu vertiefen. Es wurde festgestellt, dass einige neue Mitglieder dem Raum beigetreten sind, darunter Francesca und Cindy vom BioRender-Team. Zuvor wurde eine Umfrage veröffentlicht, und obwohl nur ein kleiner Teil der Anwesenden antwortete, war es ein ausgewogener Querschnitt aus BioRender-Nutzern und Nicht-Nutzern sowie Immunologen, Molekularbiologen und anderen. Viele Teilnehmer arbeiten zusammen oder erhalten Feedback zu ihren Abbildungen von Kollegen aus ihrem direkten Team, und viele müssen Präsentationen für das obere Management, das Management-Team, Kollegen aus der Kommunikationsabteilung oder andere erstellen.

Hier ist ein Beispiel für ein schnelles Vorher-Nachher-Ergebnis, das in einer Live-Überarbeitung einer Abbildung erzielt wurde. Die wissenschaftliche Grundlage war vorhanden, aber der Informationsfluss war etwas schwer nachzuvollziehen. Das Bild wurde in eine Z-Formation gebracht, was sehr hilfreich war, um die Geschichte zu strukturieren und sie viel leichter verständlich zu machen. Das Prinzip der Nähe wurde ebenfalls genutzt, um Elemente, die sich auf dasselbe Konzept beziehen, eng beieinander zu gruppieren.

Sie sind besser ausgerichtet, was das Bild sofort übersichtlicher macht. Manchmal reicht es schon, die Elemente ein wenig zu verschieben und Platz zwischen den Abschnitten zu lassen – auch das ist das Prinzip der Nähe. Hier ist ein weiteres Beispiel, um den Punkt zu verdeutlichen. Wir sind noch einen Schritt weiter gegangen und haben die Hierarchie von Text, Schriftart und Typografie genutzt. Wir haben also die Zwischenüberschriften fett gedruckt, die Nummern eins, zwei, drei und vier hinzugefügt und dann alles so ausgerichtet, dass zwischen den einzelnen Schritten klare visuelle Freiräume entstehen und eine saubere Trennung der Konzepte pro Schritt erreicht wird. Das mag zwar nach sehr grundlegenden Prinzipien klingen, aber es ist ein guter Einstieg, um sich an die Erstellung einer komplexen Abbildung als Signalweg heranzuwagen.

Tipp Nummer zwei: Ich werde ein wenig Theorie behandeln, und bei Punkt drei und vier werden wir in die Anwendung eintauchen und in einem kleinen Workshop die Abbildung zum Leben erwecken. Ein wenig Hintergrundwissen: Ich weiß nicht, wie viele von Ihnen schon einmal einen Designkurs belegt oder etwas über Farbenlehre gelernt haben, aber es gibt im Grunde drei Dimensionen der Farbe. Sie müssen das nicht auswendig lernen, ich wollte es nur erwähnen, damit Sie die Begriffe verstehen, falls ich sie verwende. Farbton ist nur ein schickerer Name für die Farbe selbst – Rot ist ein Farbton, Grün ist ein Farbton, Gelb ist ein Farbton. Jeder Farbton kann einen Wert haben, was im Grunde nur die Helligkeit oder Dunkelheit der Farbe beschreibt. Ich würde sagen, das ist der wichtigste Punkt, um Abbildungen zu erstellen, die für farbenblinde Zielgruppen erkennbar sind und um Fokus in einem Bild zu erzeugen. Chroma ist die dritte Dimension. Wenn man es sich als XYZ-Achse vorstellt, ist Chroma im Grunde die Sättigung einer Farbe.

Hier ist ein Beispiel für einen solchen Signalweg, den wir vorhin besprochen haben und der von einem BioRender-Nutzer erstellt wurde, der ihn in unserer Vorlagenbibliothek veröffentlicht hat. Aber ich wollte zeigen, dass Ihr Auge bei einer solchen Abbildung wahrscheinlich zuerst auf das TGF-Beta sowie auf die Phosphate gefallen ist, weil diese die höchste Sättigung und den höchsten Kontrast aufweisen – genau dorthin wandert unser Blick. Ähnlich wie Bienen von Bereichen mit dem höchsten Kontrast angezogen werden, wie etwa einer Blume, verhält es sich auch bei einem solchen Signalweg. Man kann es sich als die Blume Ihres Stilllebens oder Ihres Signalwegs vorstellen. Wenn ich nun den Fokus ändere und die Sättigung sowie den Wert auf einen anderen Teil der Abbildung verlagere, wird Ihr Auge zuerst dorthin wandern. Ich wette, Ihr Blick fiel im zweiten Bild in Abbildung zwei auf die DNA oder das Innere des Zellkerns, einfach nur durch die Änderung der Farbe, der Sättigung und des Wertes. Es ist etwas dunkler, hat einen höheren Kontrast und eine hellere Farbe. Sie haben also eine sehr präzise Kontrolle darüber, wohin Ihre Zuschauer zuerst schauen sollen. Vielleicht ist das der Schwerpunkt Ihrer Forschung, und Sie möchten sicherstellen, dass dieser Teil in einer komplexen Abbildung nicht übersehen wird.

Tipp Nummer drei: Verwenden Sie Deckkraft sparsam. Wenn Sie überall auf der Seite zu viel Sättigung und Kontrast verwenden, ist das so, als würden Sie einen Textmarker nehmen und einen ganzen Absatz in einem Buch oder eine ganze Seite markieren. Sie sollten dies sehr sparsam einsetzen, fast wie ein mächtiges Werkzeug, das nur an den richtigen Stellen zum Einsatz kommt. Meistens können Sie alles andere auf fast Graustufen reduzieren, nur Pastellfarben oder sanftere Töne. Sie müssen nicht mit einem Textmarker jedes einzelne Protein hervorheben. Ich wollte nur zeigen, wie wirkungsvoll es ist, die Aufmerksamkeit des Betrachters auf bestimmte Bereiche zu lenken.

Sind diese drei Abbildungen exakt gleich, nur mit geänderter Farbe? Ein weiterer Punkt, der hier wichtig ist, nicht unbedingt nur für Signalwege: Ich bin sicher, Sie haben in der Vergangenheit schon ähnliche Abbildungen erstellt. Eine Herausforderung bei Zell-zu-Zell-Abbildungen besteht darin, dass Zellkerne von Natur aus dunkler gefärbt sind. Ich sehe oft, wie Wissenschaftler Schwierigkeiten haben, Diagramme mit Zellkernen oder Vorgängen darin zu erstellen, weil das Ergebnis am Ende sehr verwaschen wirkt, da die Zellkerne so dunkel sind. Es ist schwierig, Elemente darüber zu legen oder zu schichten, ohne dass sie untergehen. Ein Trick, den wir in der Industrie gerne anwenden, ist die Umwandlung der Abbildungen in Graustufen, um zu sehen, wo der Kontrast zum Problem wird. Wo es sehr helle oder sehr dunkle Bereiche gibt. Sie sehen hier, dass die doppelsträngige DNA tatsächlich wie einzelsträngig aussieht, wenn ich sie in Schwarz-Weiß umwandle. Es wird sofort deutlich, dass es Kontrastprobleme gibt, wenn man in Graustufen konvertiert, während die Farbversion täuschen kann, weil man denkt, dass sie allein durch die andere Farbe für das bloße Auge erkennbar ist. Und offensichtlich verschwindet hier das Label "Apoptose". Was Sie also tun sollten, ist den Kontrast dieser Labels zu erhöhen. Hier haben wir die Deckkraft genutzt und mit der Transparenz gespielt, um die Hintergrundelemente etwas heller zu machen. Wir haben also diese T-Zelle genommen und ihre Deckkraft verringert. Ich glaube, das hier ist bei 100 Prozent und das andere bei etwa 80 Prozent Transparenz, was ihr eine hellere Farbe verleiht. Es verändert die Farbe komplett, und Sie haben eine präzise Kontrolle, wenn Sie die Deckkraft ändern. Sie müssen vorsichtig sein, wenn Ihr Hintergrund sehr dunkel ist, da dies natürlich durch die Zelle hindurchscheinen würde. Aber wenn nicht – und wir empfehlen, so oft wie möglich einen weißen Hintergrund zu verwenden –, ist Transparenz ein sehr mächtiges Werkzeug. Ich denke, das verdeutlicht den Punkt zum Kontrast. Ich würde gerne die letzten beiden Tipps direkt in der Anwendung selbst behandeln. Die letzten beiden Tipps waren das Heranzoomen, um den korrekten Maßstab zu zeigen und den Betrachter zu orientieren, und der vierte Punkt ist die korrekte Verwendung von Linien und Pfeilen oder zumindest die konsistente Verwendung. Das ist sehr, sehr wichtig, um Ihre Geschichte korrekt zu erzählen.

Ich gehe zurück in BioRender und kann kurz innehalten, falls es Fragen im Chat gibt. Es sieht so aus, als wären ein paar bereits beantwortet worden. Hallo Shiz, eine Frage war, wie man in BioRender in Graustufen konvertieren kann. Wenn Sie diese Option zeigen könnten, wäre das sehr hilfreich für Ihren Tipp. Ja, absolut. Warum öffne ich nicht einfach die Abbildung, die ich gerade erstellt habe? Es gibt hier ein paar Abkürzungen. Es gibt dieses kleine Schwarz-Weiß-Symbol und tatsächlich auch dieses kleine Fragezeichen, das bedeutet, dass es ein kurzes Tutorial zu dieser Funktion gibt. Wenn ich darauf klicke, zeigt es mir nicht nur, wie es geht, sondern auch den Wert – oder ich verwende den Wert aus verschiedenen Gründen – der Wichtigkeit der Verwendung von Graustufen. Ich kann also auf diesen Knopf klicken, und es wird die Farbe auf meiner Arbeitsfläche vorübergehend entfernen, wie Sie sehen konnten. Da ist die Farbversion und hier die Schwarz-Weiß-Version. Es gibt diesen kleinen Knopf hier. Ich kann auch einfach auf "View" – "On Canvas" – "Grayscale" gehen. Wenn ich darauf klicke, passiert dasselbe. Das Coole ist, dass ich tatsächlich weiterzeichnen kann, als wäre ich im Farbmodus, da es mir auch ermöglicht zu sehen, was der tatsächliche Wert einer Farbe ist, wenn ich in einer Welt aus Schwarz und Weiß lebe. Man sieht also, wie es sich in einen anderen Grauton ändert. Es ist eine sehr wirkungsvolle Gewohnheit, in Werten und Kontrasten zu denken. Wenn Sie diese Farbe wählen würden, weiß ich nicht wirklich, wie sie in Farbe aussieht, aber ich weiß, dass sie für farbenblinde Zuschauer erkennbar wäre und genug Kontrast selbst für den durchschnittlichen Betrachter bietet. Das ist die Konvertierung in Graustufen.

Um uns in der App aufzuwärmen, wollte ich sechs verschiedene Möglichkeiten zur Verwendung von Pfeilen und Linien durchgehen. Das ist ein sehr schnelles Tutorial, das ich gerne mit jedem durchgehe, um die Grundlagen abzudecken. Wenn Sie das schon gesehen haben, ist das großartig. Das wird eine schöne Auffrischung sein. Eine Möglichkeit, Linien und Pfeile zu verwenden, ist natürlich das Zeichnen perfekt kreisförmiger Pfeile, um eine Art Feedbackschleife oder einen zyklischen Signalweg zu erstellen. Wir haben diese wirklich coole Option für kreisförmige Pfeile in BioRender. Wenn Sie also auf "Insert" – "Line" – "Circular Arrow" gehen, sind alle diese Optionen perfekte Kreise. Sie verhalten sich also nicht wie unsere anderen Pfeile, und man kann aus einem kreisförmigen Pfeil keine geraden Pfeile machen. Tatsächlich sieht es so aus, als gäbe es hier ein weiteres kleines Tutorial, das ich mir ansehen könnte. Ich kann den Pfeil in viele Stücke schneiden. Ich kann die Länge dieses kreisförmigen Pfeils ändern, und er folgt einem perfekten 360-Grad-Bogen. Das ist wirklich cool. Ich schließe das Tutorial und werde es jetzt verwenden. Diese Abbildung, die Sie hier sehen, können wir wahrscheinlich als Vorlage hochladen, falls Sie damit herumspielen möchten. Das ist nur eine Abbildung, die ich mit BioRender-Symbolen erstellt habe. Ich habe BioRender quasi "gehackt", damit es wie dieses Arbeitsblatt aussieht, nur damit wir Ihnen die Pfeil-Option zeigen können. Hier ist er also, ein perfekt kreisförmiger Pfeil. Sie müssen also nicht raten, wie man einen erstellt, und ich werde ihn hier in der Mitte teilen, das können Sie auch tun. Ich liebe dieses Werkzeug, um kreisförmige Bewegungsaktivierung zu zeigen. Wir können ihn als Pfeil mit Spitze lassen, ich denke für Hemmung verwende ich die abgeflachte Pfeilspitze. Diese hier, genau. Und vielleicht gehe ich noch einen Schritt weiter und farbliche Kennzeichnung, um – wieder unter Verwendung von Farbe – antagonistische Verhaltensweisen zu zeigen, schauen Sie sich das an. Und meine Arbeitsfläche wurde etwas dunkler, das liegt daran, dass ich mich in einem sogenannten gruppierten Symbol befinde. Es ist wie eine isolierte Welt, in der sich das Ganze als ein Stück bewegt, wenn ich jetzt per Doppelklick herausgehe, während ich bei einem Doppelklick auf die Gruppe diese Objekte bearbeiten kann, aber die Dinge dahinter nicht wirklich auswählen kann. Das ist beabsichtigt. Also mache ich das rückgängig.

Das war die Verwendung von kreisförmigen Pfeilen und wie man Dinge beschriftet. Das kann beim Erstellen von Signalwegen wichtig werden, wenn Sie bestimmte Dinge beschriften und diese Beschriftungslinien von Bewegungspfeilen unterscheiden müssen. Das ist sehr wichtig, denn manchmal sehen wir die Verwendung eines Pfeils, um Bewegung zu zeigen, aber er wird auch für Beschriftungszwecke genutzt. Wenn Sie also so etwas verwenden, sieht es vielleicht so aus, als würden die Vesikel in die Zelle eintreten, anstatt sie nur zu beschriften. Deshalb ist die konsistente Verwendung von Pfeilen, Linien und Beschriftungslinien sehr wichtig. Für Beschriftungen verwenden wir, insbesondere wenn man das komplexeste Lehrbuch zur Neuroanatomie aufschlägt, immer Linien mit diesem kleinen Punkt am Ende. Noch besser ist eine Linie mit einem Punkt am Ende und einem Knick in der Linie, und hier ist der Grund. Hier ist ein Vesikel, und dieser Punkt am Ende ist ziemlich aggressiv. Ich werde die Größe vielleicht ein wenig verringern. Sie können die Größe dieses Kreises ändern. Da haben wir es. Dann werde ich Alt-Ziehen, um zu kopieren. Ich glaube, für einen PC ist es Strg-Ziehen oder vielleicht Option-Ziehen oder Alt-Ziehen. Lassen Sie mich die Spickzettel öffnen. Wenn jemand ein PC-Nutzer ist, kann er es vielleicht kurz sagen. Oh, Duplizieren. Bei mir ist es Option-Ziehen, weil ich auf einem Mac bin. Also muss es für PCs Alt-Ziehen sein. Auf jeden Fall können Sie das tun und beim Zeichnen sehr schnell kopieren. Sehen Sie, wie ich dieses Gelenk im Ellenbogen habe? Es macht das Ende frei, um auf alles zu zeigen, was ich möchte. Vermeiden Sie natürlich auch, Beschriftungslinien und Signalweglinien zu kreuzen. Das wird sehr verwirrend.

Lassen Sie uns die Dinge einfach ordentlich und sauber halten. Der Kontrast wird in diesem Bereich etwas dunkel, aber ich denke, wir kommen noch gut zurecht. Kommen wir zur dritten Art von Linie: das Unterteilen mit gepunkteten Linien. Das erinnert mich an diese Papierpuppen-Ausschnitte aus meiner Kindheit. Gepunktete Linien eignen sich hervorragend für Dinge wie Schnittlinien, insbesondere bei einem Signalweg, um Dinge zu zeigen, die vielleicht passiert sind, passieren werden oder vielleicht weniger wahrscheinlich sind als andere Ereignisse. Das ist eine sehr effektive Art, eine gepunktete Linie zu verwenden. Ich würde es nicht übertreiben und für jeden einzelnen Teil Ihres Signalwegs gepunktete Linien verwenden, da es sonst etwas unruhig werden kann. Das sind alles Profi-Tipps. Ich kann mir nicht vorstellen, das aus vielen Gründen zu verwenden, aber wenn Sie es etwas ausgefallener mögen, ist das eine coole Art, das darzustellen.

Wenn ich herauszoome, verleiht es dem Ganzen eine Art Nike-Swoosh-Effekt, der sich durch den Raum bewegt, eine Art Illusion. Okay, mit diesen sechs verschiedenen Pfeiltypen können Sie eine Menge verschiedener Konzepte darstellen. Ich denke, das war genug Wiederholung zu Linien. Ich gehe zurück zu meinem Ordner, und das Schöne an BioRender ist, dass es automatisch speichert. Wenn also etwas mit Ihrem Browser passiert, sagen wir, Zoom verbraucht zu viel von meinem Internet und mein Chrome-Browser stürzt ab, kann ich tatsächlich in der Zeit zurückgehen, indem ich die Versionsgeschichte für jede Abbildung verwende, die ich erstelle. Wenn ich zum Beispiel auf 14:33 Uhr zurückgehe, wird das Bild angezeigt, mit dem ich begonnen habe. Und dann können Sie wirklich jede Version der Abbildung wiederherstellen, die Sie gerade erstellen. Nur damit Sie wissen, dass das als Option vorhanden ist.

Großartig. Und gibt es neue Fragen? Ich denke, wir kommen hier gut voran. Fantastisch. Und eine Sache, die ich beim Erstellen von Signalwegen anmerken möchte: Ich kann heute wahrscheinlich keine erstellen, die den Bedürfnissen aller gerecht wird, aber ein letzter Punkt, den ich mitgeben möchte, ist die Idee, weichere Kurven und Linien in Ihre Abbildung einzubauen. Sie sehen hier, dass wir einen ziemlich guten Start für ein relativ komplex aussehendes Bild haben, ein Signalweg-Diagramm oder einen Signalweg in einer Umgebung. Sie können den Linientyp tatsächlich von einer dieser perfekten Ellenbogen-Linien in eine geschwungene, glatte Linie ändern. Es sieht so aus, als würde das hier bereits geschehen.

Jedes Mal, wenn Sie diese kleine Linie hier sehen, die – es ist schwer zu sehen in diesem Maßstab, hoffentlich können Sie es sehen – sich vom Eckknoten unterscheidet. Sie hat diese Art von Donut-Farbe, eine weiße Umrandung, das dunkle Zentrum. Dies wird Ihre Kurven tatsächlich glätten. Das ist eine schöne Möglichkeit, das Ganze etwas fließender aussehen zu lassen und die harten Kanten Ihres Signalwegs zu entfernen. Ich würde das auch empfehlen, wenn Sie es etwas freundlicher gestalten möchten. Ich denke, das wird tatsächlich beide Kanten glätten, und das ist ein wenig kleinlich. Ich glaube, es bringt Ihre Abbildung von 80 % fertig auf vielleicht 100 %, sobald Sie diese wenigen Optionen implementieren. Und falls Sie es noch nicht bemerkt haben: Innerhalb von BioRender haben wir das bereits bei den Kontrast- und Wertoptionen berücksichtigt. Das sind alles Profi-Tipps.

Wenn ich das also entferne und eine Form mit Text einfüge, ist das tatsächlich exakt dasselbe, als wenn Sie hier unten hingehen und ein Protein erstellen würden. Warum mache ich das nicht einfach für die Demo? Also Label, und ich kann "TGF beta" eintippen. Beta ist ein griechischer Buchstabe, also gehe ich hier nach oben und füge ein Symbol ein. Das ist wirklich schön, denn jetzt muss ich nicht zu Google gehen und "Beta" eintippen. Kopieren und einfügen. Tatsächlich ist hier das Dropdown-Menü, Sie haben also alle gängigsten griechischen Buchstaben. Wir haben sogar diese Art von Auf- und Ab-Pfeilen, wenn Sie eine Zunahme oder Abnahme zeigen, was wiederum sehr häufig in Signalwegen vorkommt. Sie können diese gerne verwenden. Aber ich brauche nur das Beta-Symbol, also nehme ich das und lösche diese anderen Buchstaben oder Symbole, verkleinere es ein wenig. Ich könnte das in eine Pillenform verwandeln, wenn ich vielleicht über ein spezifisches Protein spreche, das ist also auch sehr schön.

Um also konsistent mit der oberen Reihe zu sein, mache ich daraus ein leicht geschwungenes Objekt, und ich mag das Farbschema des roten Hintergrunds und des weißen Textes. Sie sehen hier, die ersten zwei Reihen unserer Optionen haben eine dunkle Schrift auf hellem Hintergrund, das ist sehr beabsichtigt von uns, und das Gegenteil ist der Fall, also ein dunkler Hintergrund und eine helle Schrift. Und das ist wieder wichtig, um diesen Kontrast beizubehalten. Sie möchten es sozusagen "narrensicher" machen, damit Sie beim Erstellen von Signalwegen keine Fehler beim Kontrast machen. Hier ist also diese rote Option. Ich denke, wer auch immer diese Vorlage erstellt hat, hat eine unserer Vorlagenfarben verwendet, also passt es jetzt perfekt. Das ist also eine wirklich schöne Art, Proteine und Moleküle in Ihre Abbildung einzubinden. Auch hier kann ich mit Option- oder Alt-Ziehen mehrere Stapel von Proteinen erstellen. Das macht es wirklich einfach, und ich denke, die Magie liegt wirklich in diesen vorausgewählten, geprüften Farben, sodass Sie, egal welche Farbe Sie verwenden, kein Risiko haben, dass sie sich beißen. Das ist ein ganz anderes Konzept, wie man Farben nicht kollidieren lässt. Ich denke, das ist ein fortgeschrittener Workshop, den wir durchführen sollten, aber auf jeden Fall ist die Verwendung unserer voreingestellten Farben für Formen ein guter Anfang, um zu wissen, dass Sie keine beißenden Farben oder Bilder mit geringem Kontrast haben werden.

Okay, und mal sehen, ich klicke auf Vorschau, nur um zu sehen, wie das aussieht. Es ist sehr schön und zentriert. Der Informationsfluss ist ziemlich gut. Er verläuft von oben nach unten, und manchmal kommen wir nicht umhin, zwei Kompositionen zu verwenden, also von oben nach unten und dann unten von links nach rechts, aber ich denke, im Allgemeinen folgt es einem ziemlich schönen kompositorischen Fluss.

Alles klar, in den letzten Minuten werde ich Ihnen einfach zeigen, wie man eine Abbildung von Grund auf neu erstellt, nur um Ihnen zu zeigen, dass es überhaupt nicht einschüchternd ist, in BioRender zu starten. Ich lege das Fundament für meine Abbildung, was vielleicht nur eine Membran ist. Auch hier haben einige von Ihnen BioRender schon oft benutzt, also wird das eine Wiederholung sein, aber ich verwende gerne die Phospholipid-Doppelschicht, wann immer ich kann. Manchmal ist sie nicht notwendig, aber wir haben sie hier bereits vorgefertigt. Das ist ein Symbol, das eine Art abgeflachtes Objekt ist. Ich kann die Farbe des Zytosols ändern, aber ich kann nicht wirklich die einzelnen Phospholipid-Köpfe ändern. Wenn Sie die Phospholipid-Köpfe ändern möchten, würde ich unsere Pinsel-Option empfehlen. Sie ist hier mit diesem kleinen blauen Pinsel-Logo dargestellt. Wenn ich also diese hier herausziehe, die meiner Meinung nach dem Symbol, das ich herausgezogen habe, ziemlich ähnlich sieht, und ich ziehe das Ende bis zum Rand der Arbeitsfläche, ist das tatsächlich etwas flexibler, und ich kann die Form davon ändern, falls nötig. Ich werde sie wieder in eine dunklere Farbe ändern. Ich denke, das sieht gut aus. Sieht zwar etwas unsinnig aus, aber das ist in Ordnung.

Zellkern – nehmen Sie einfach diesen hier. Das Erste, was ich sehe – hängen Sie ihn übrigens über den Rand. Alles, was über den Rand hinausgeht, wird nicht exportiert, Sie können das also als eine Art Arbeitsbereich nutzen. TLR, da ich bemerkt habe, dass viele von Ihnen Immunologen im Raum sind, und Sie können diese vereinfachten Proteine manchmal verwenden, und wir holen bei diesen kanonischen Signalwegen noch auf, aber manchmal haben wir bereits Gruppen oder Cluster von Proteinen erstellt, die Sie einfach auf Ihre Arbeitsfläche ziehen können. Und auch hier ist dies ein gruppiertes Symbol. Wenn ich also darauf doppelklicke, gelange ich in einen anderen Modus, in dem ich wieder die Farbe dieser Pillenform ändern und sogar das Label selbst anpassen kann.

Sieht schon richtig gut aus, fast schon natürlich. Und noch einmal, auch wenn es vielleicht etwas unsinnig klingt: Ich füge jetzt ein paar Pfeile hinzu, um zu zeigen, dass sich Dinge im Raum bewegen. Huch. Ich nutze Alt-Ziehen, um diese Bewegung darzustellen. Noch einmal Alt-Ziehen. Vielleicht passiert hier dann etwas. Vielleicht dringt es in diesem Stadium in den Zellkern ein, und dann passiert etwas anderes. Ich kopiere das hier und füge es ein. Später passiert dann etwas, bei dem es die Zelle wieder verlässt. Ich bin mir hier noch nicht ganz sicher, aber ich lege erst einmal das Fundament.

Okay, vielleicht füge ich noch etwas DNA hinzu, um die Abbildung abzurunden. Es gibt viele Möglichkeiten, DNA zu illustrieren. Sie können wieder unsere flachen Icons verwenden, das sind wunderschön gerenderte 2D-Vektorformen wie diese hier. Ich kann die Farbe direkt vor Ort noch ein wenig anpassen. Wenn Sie etwas mehr Flexibilität benötigen, haben wir auch einen DNA-Pinsel, ähnlich wie bei der Membran. Falls Ihre Geschichte aus irgendeinem Grund eine komplexere Form erfordert, können Sie gerne unseren DNA-Pinsel nutzen. Für diesen Zweck verwende ich jetzt aber erst einmal das hier, und dann noch ein Protein. Ich liebe diese generischen Protein-Formen. Die werde ich jetzt verwenden. Wie auch immer, ein sehr, sehr vereinfachter Signalweg hier. Es geht natürlich noch viel komplizierter, aber ich wollte nur die Grundlagen zeigen, wie man anfängt. Wenn ich auf Vorschau klicke – voilà. Und zurück zu meiner Galerie. Gut, wir haben viele Konzepte behandelt, und ich sehe, dass wir langsam zum Ende kommen. Ich mache also vielleicht eine kurze Pause und schaue, ob ich noch Fragen beantworten kann, die bisher offen geblieben sind.

Es gibt tatsächlich eine Frage aus dem Publikum: Was ist der beste Weg, um auf der Arbeitsfläche das Hineinzoomen von der Gewebeebene über die Zellebene bis hin zur Proteinebene zu visualisieren? Das ist eine großartige Frage. Ich empfehle, mit kreisförmigen Ausschnitten zu arbeiten. Hier ist eine vereinfachte Version: Wir übernehmen das aus anatomischen Zeichnungen, indem wir eine Art Zoom-Callout verwenden. Das ist eine einfache Methode, um Zoom-Effekte bei komplexen Darstellungen zu zeigen. Was wir gemacht haben, ist ein kreisförmiger Ausschnitt dieser Mausstruktur, den wir um einen Kreis gelegt haben. Bei Signalwegen ist das jedoch anders. Hier ist ein weiteres Beispiel, wie man das Innere einer dieser winzigen Vertiefungen zeigt und so den Maßstab auf einem sehr kleinen Bereich verdeutlicht. Das ist also eine Möglichkeit. Eine andere Methode, die wir bei zellulären Signalwegen gerne anwenden, ist, einfach einen Rahmen um zwei Formen zu ziehen. Sie können diesen verkleinern, viele der unwichtigen Objekte entfernen und es sehr simpel halten. Wenn ich mich auf einen bestimmten Bereich konzentrieren würde, sagen wir, das wäre der Fokus meiner Geschichte, dann ist er in diesem Maßstab natürlich recht klein und schwer zu erkennen. Aber Sie möchten den Betrachter orientieren und sagen: „Hey, das ist eine Krebszelle, die mit einer T-Zelle interagiert.“ Also erstelle ich ein kleines Fenster – manche nennen es ein chirurgisches Fenster –, das einfach eine Orientierungshilfe bietet: „Das ist der Teil des Körpers, über den ich spreche.“ Und dann zoome ich natürlich hinein, um diese Nahaufnahme in einem größeren Maßstab zu erstellen. Ich hoffe, das hilft weiter. Ich würde definitiv sagen, dass dies eine der beliebtesten Methoden ist.

Das wird wirklich knifflig, wenn man zum Beispiel ein Virus zeigt, das mit einer Zelle interagiert und dann mit einer anderen, sodass man viele dieser Maßstabsänderungen hat. Wenn Sie es schaffen, so etwas darzustellen, ist das großartig. Manchmal kann man die Zelle sogar drehen, um diese Art von Umgebung zu schaffen. Natürlich ist alles, was über den Rand Ihrer Arbeitsfläche hinausragt, nicht sichtbar, was dann zu Ihrem Fokusbereich wird. Und natürlich sollten die Farben zu dem passen, in das Sie hineinzoomen – ob Blau oder Orange –, damit Sie nicht diese seltsamen, riesigen Proteine auf einer winzigen Zelloberfläche haben. Vorschau, und da haben wir es.

Entschuldigung, das war etwas gehetzt, aber das wäre ein Ansatz, wenn Sie mehrere interagierende Zellen haben. Natürlich können Sie das vervielfältigen, um es auch für viele andere interagierende Zellen zu verwenden. Vielen Dank übrigens für die wirklich tollen Fragen. Und für diejenigen, die sich fragen, wie ich hier herumschwenke: Ich drücke die Leertaste, um Dinge zu verschieben. Wenn Sie nicht genug Platz haben, können Sie jederzeit Ihre Bibliothek schließen, um mehr Platz auf Ihrer Arbeitsfläche zu schaffen – nur damit Sie wissen, dass diese Option existiert. Wir nähern uns drei Uhr, oder wo auch immer Sie auf der Welt sind – bei uns in Toronto ist es drei Uhr. Vielen Dank, dass Sie bis zum Ende dabei geblieben sind. Ich hoffe, Sie haben das eine oder andere gelernt, und wir wissen es sehr zu schätzen, dass Sie heute bei uns waren.