Meilleurs conseils BioRender pour vos demandes de subvention

Présentation

Très bien, excellent. Nous allons explorer quelques conseils que je souhaitais partager. Pour gagner en efficacité et rester concentrée, j'ai voulu vous proposer des points clés mémorables afin que vos figures de subvention soient impeccables la prochaine fois, et, je l'espère, éviter certains défauts de conception gênants qui ont été abordés lors de l'excellente table ronde précédente. J'utilise BioRender, mais ces conseils sont universels ; quel que soit l'outil que vous utilisez, vous pourrez les appliquer. Cependant, petite parenthèse publicitaire, je vais utiliser BioRender. Nous utilisons la fonctionnalité de diapositives de BioRender. Je sais qu'elle est relativement récente et que peu d'entre vous la connaissent peut-être encore, mais vous verrez que je peux utiliser BioRender comme une toile de composition multi-figures. Dans le panneau de droite, je vais utiliser BioRender pour présenter une conception au sein de cette fonctionnalité de diapositives. C'est un peu méta, mais suivez-moi.

Ce webinaire sera à nouveau axé sur la conception. Comme certains intervenants l'ont déjà mentionné, l'essentiel est de se concentrer sur votre figure de subvention. Je pense que les mêmes principes de design s'appliquent à une pièce en désordre. Un manque de concentration, trop de couleurs, trop d'objets, des éléments mal placés, l'absence de point focal... Je suis certaine que vous ressentez cette impression lorsque vous regardez une figure encombrée, ce qui rappelle presque une pièce en désordre. Nous appliquerons donc certains de ces principes au fil de ces conseils. Bien sûr, vous pouvez expérimenter avec la couleur, mais utilisez-la avec parcimonie. Dans cet exemple, ces options de couleur turquoise très audacieuses sont utilisables, et nous vous encourageons même à les intégrer, mais encore une fois, faites-le avec parcimonie et soyez sélectifs afin que ces zones attirent l'œil de votre évaluateur vers la partie importante de votre figure. J'espère que c'est clair : lorsque vous utilisez la couleur, faites-le avec une extrême modération.

Je vois une question indiquant que la moitié de l'écran n'est pas visible. Est-ce que tout va bien de votre côté ? Dites-le-moi si ce n'est pas le cas. De mon côté, tout semble correct. D'accord, merci de m'avoir prévenue.

Par ailleurs, comme le Dr Miranda l'a déjà évoqué, pensez au produit final. Qu'il s'agisse d'un objectif spécifique ou d'une mise en page imposée, réaliser une belle figure est une chose, mais elle doit s'intégrer dans la conception globale. Cela signifie généralement qu'une fois votre figure terminée, je vous conseille de la réduire à la taille d'un texte factice pour vérifier qu'elle reste lisible aux dimensions requises. Vous créez une figure sur un grand écran, mais elle devra finalement tenir sur la taille d'une carte de visite. Il est inutile d'ajouter des détails qui ne seront pas visibles dans le format final. Gardez cela à l'esprit. J'ai fait une capture d'écran de l'image du Dr Murin, j'espère que cela ne pose pas de problème, mais je trouvais que c'était un exemple fantastique des principes de base d'une palette de couleurs cohérente. Vous remarquerez qu'il a utilisé une police différente pour la légende par rapport à celle du texte principal dans la section des objectifs spécifiques. Si vous revenez en arrière dans l'enregistrement de l'intervention du Dr Murin, vous verrez son explication sur la mise en page, mais je tenais à souligner cet exemple en particulier.

Pour les 20 prochaines minutes, le temps passe vite quand on s'amuse, je vais me concentrer sur deux conseils. Deux points que je veux que vous reteniez : améliorer l'ordre de lecture de vos diagrammes ou figures, et savoir créer un point focal dans votre figure grâce à quelques sous-conseils de base. L'ordre de lecture et la création d'un point focal : si vous parvenez à maîtriser ces deux aspects pour votre demande de subvention, votre figure sera vraiment percutante.

Ordre de lecture

La première chose est l'ordre de lecture : de gauche à droite, de haut en bas ou dans le sens des aiguilles d'une montre. Cela semble évident, mais c'est une erreur que nous voyons fréquemment. Les figures doivent toujours se lire de gauche à droite, de haut en bas, ou de manière cyclique s'il s'agit d'un processus répétitif.

Processus répétitif : pour les objectifs spécifiques, qu'il y en ait deux, trois ou un seul, comme l'argumentation le suggère, le flux doit toujours aller de gauche à droite et de haut en bas. Vous ne devez pas imposer un chemin tortueux à l'évaluateur pour qu'il se perde dans votre figure. Cela doit rester très simple.

Soit dit en passant, j'utilise Annotate comme extension sur Google Chrome. Cela ne fait pas partie de l'application BioRender ; je l'utilise uniquement pour la présentation. Voilà pour l'ordre de lecture. Vous pouvez choisir une ou deux de ces règles lorsque vous composez votre figure. Voici un exemple. Quelques volontaires courageux ont soumis leurs figures de subvention pour une évaluation en direct, un peu comme des heures de permanence.

Ce que j'aime faire, c'est suivre le parcours du début à la fin. Si je devais suivre le regard pour voir où je porte mon attention en abordant une figure, c'est généralement en haut à gauche. Ici, je vois des flèches qui m'orientent vers certaines zones. Deux flèches. Puis je vois une flèche qui revient, ce qui me renvoie dans une boucle. Et il se passe quelque chose en bas. Je pense qu'ils veulent que je termine ici. Si vous cherchez le chemin de moindre résistance, il y a une friction assez élevée pour identifier le début et la fin de l'histoire. C'est un excellent exercice à faire sur n'importe quelle figure : tracez le chemin avec votre doigt ou un marqueur pour voir où votre œil est dirigé. Cela est directement corrélé à l'épuisement que votre lecteur ressentira en essayant d'interpréter votre figure.

Nous avons donc recréé la figure en la faisant pivoter d'environ 90 degrés. Il y a toujours un moyen d'améliorer la mise en page. Dans ce cas, nous avons pris la figure, l'avons tournée sur le côté et avons repositionné quelques éléments. Le contenu est resté le même ; il s'agit simplement de la mise en page et de la directionnalité de l'ordre de lecture. Nous avons maintenant un bel effet de cascade de haut en bas. Il y a quelques flèches pointant vers le haut, mais ce n'est pas aussi intense qu'auparavant, où le regard était baladé partout sur la page. De manière générale, il semble que cet auteur souhaite que la figure soit lue de haut en bas. Ce changement rapide a rendu l'ordre de lecture clair et concis, tout en restant concentré, sans fatiguer l'évaluateur qui, rappelons-le, lira des piles de demandes et ne voudra pas perdre de temps à déchiffrer une figure labyrinthique.

Voilà pour l'ordre de lecture. Voici un autre exemple. Si l'image que vous présentez est plus axée sur le cellulaire, faites attention à l'emplacement des chiffres et des flèches. Si je suis le parcours de 1 à 4, mon œil est entraîné dans des boucles vers différentes parties de la figure. Si nous réorganisons cela en faisant pivoter l'image de 90 degrés, ce qui a demandé un peu plus de travail, nous obtenons un résultat plus fluide. Nous avons fait en sorte que l'histoire commence en haut à gauche, ce qui est généralement un bon point de départ, puis qu'elle se déroule selon un schéma cyclique. Nous avons créé des flèches plus grandes et réorganisé le récit pour que les étapes 1, 2, 3 et 4 suivent un cercle. Ce n'est pas parfait, mais le flux cyclique permet à l'œil de suivre l'histoire plus facilement. Parfois, vous aurez des sous-histoires, ce qui est acceptable, mais différenciez-les peut-être avec des flèches plus petites. Si je retire mes flèches, vous verrez que l'attraction principale se situe sur les bords, avec des histoires secondaires à l'intérieur, ce qui est très bien. Mais si l'épaisseur et le poids de vos flèches sont identiques partout, vos évaluateurs ne sauront pas quel est le point central de votre histoire.

Ce conseil portait donc sur l'ordre de lecture : de gauche à droite, de haut en bas ou dans le sens des aiguilles d'une montre. Assurez-vous de respecter cela. Enfin, pour créer un point focal dans votre figure, car beaucoup de gens nous disent : "Ma figure semble très encombrée, je ne sais pas quoi supprimer ou comment la redessiner. On me conseille de laisser des espaces vides, mais je ne sais pas comment faire." Voici quelques conseils pour créer ce point focal.

Température et saturation des couleurs

Transparences et adaptation au public : j'espère que cela prendra tout son sens au fur et à mesure que nous aborderons chaque point.

La température des couleurs est assez explicite. Qu'est-ce que la température ? C'est le chaud et le froid. C'est ainsi que l'on peut classer les couleurs. Si je prends ces objets, je peux les dupliquer dans BioRender avec un raccourci. Il existe une règle empirique dans le design : les couleurs froides sont plus apaisantes pour l'œil. Souvent, les protagonistes d'une histoire sont représentés en bleu, violet ou vert, surtout dans les figures scientifiques. Les couleurs chaudes ont tendance à suggérer les antagonistes, les "méchants", ou des phénomènes comme l'inflammation ou le sang, qui dénotent des impacts négatifs dans le corps.

Je suggère donc d'inverser les rôles. Si vous avez une cellule cancéreuse de couleur froide, vous créez une histoire étrange où elle finit par ressembler au protagoniste. C'est assez simple : assurez-vous que tous vos lymphocytes, dans ce cas, sont d'une couleur froide, et que tout ce qui représente l'antagoniste est d'une couleur plus chaude. Vous voyez immédiatement que les lymphocytes sont perçus comme les "bons" et la cellule cancéreuse comme l'envahisseur, alors que sans étiquettes, vous auriez supposé l'inverse. Un conseil très simple : utilisez les couleurs chaudes et froides à votre avantage. Dans certains cas, comme pour une réponse auto-immune, vous pourriez vouloir colorer les lymphocytes avec une teinte chaude pour montrer que ce n'est pas ce que vous souhaitez voir se produire dans le corps et que vous voulez inverser ce processus.

Voilà pour la température des couleurs. La saturation est également un levier sur lequel vous pouvez jouer pour créer un point focal. Voici l'exemple d'un diagramme de voie simplifié. Cela me rappelle une pièce avec des coussins jaunes, un rideau rouge et une bibliothèque bleue. Le problème, c'est que lorsque vous colorez chaque élément d'une couleur différente, rien ne devient important. Je recommande donc de réduire la saturation, de repartir d'une base neutre et de réintroduire la couleur avec parcimonie.

Commençons par repartir de zéro. J'ai réduit les couleurs. Il s'agit exactement de la même figure, soit dit en passant. Rien n'a changé, à part la couleur. N'est-ce pas fou ? Cela change radicalement la perception des informations. J'ai donc supprimé la couleur, puis je l'ai réintégrée uniquement dans la partie supérieure. C'est là que mon regard s'est porté immédiatement, car c'est la zone de saturation la plus élevée. La saturation correspond essentiellement à l'éclat ou à l'intensité d'une couleur, par opposition à une couleur désaturée, qui tend vers le niveau de gris ou le noir et blanc. Réintroduisez progressivement la couleur dans les zones sur lesquelles vous souhaitez attirer l'attention. Est-ce le TGF bêta ? Votre attention se porte-t-elle sur ces protéines à gauche ? Ou peut-être sur l'ADN, ou plutôt sur les noyaux ? Selon l'endroit où vous souhaitez diriger le regard, c'est là que je concentrerais la saturation et même le contraste. La saturation peut vraiment devenir votre meilleure alliée si vous utilisez l'outil correctement.

Avec BioRender, vous pouvez très facilement modifier la couleur de ces bulles de texte. Si vous êtes des experts de BioRender, vous le savez déjà, mais nous proposons des palettes de couleurs prédéfinies qui permettent de sélectionner très simplement n'importe quelle couleur de l'arc-en-ciel. La police s'adaptera automatiquement à la valeur opposée : elle sera blanche sur fond sombre ou noire sur fond clair. N'hésitez pas à explorer cette fonctionnalité très pratique.

Une autre astuce consiste à prévisualiser votre travail en niveaux de gris dans BioRender. Tout le monde ne connaît pas cette technique, mais je l'utilise très souvent. Si vous entrez dans n'importe quel studio de design professionnel, vous verrez que tout le monde dispose de versions en niveaux de gris de ses créations. Il est essentiel de s'assurer que le contenu est accessible, notamment aux personnes daltoniennes, mais aussi de manière générale, car les couleurs peuvent parfois être trompeuses.

Dans ce cas précis, vous voyez clairement les cellules rouges au-dessus de ce tube, mais ces cellules se perdent dans l'ensemble. Si je prévisualise en niveaux de gris, je constate immédiatement qu'elles disparaissent. Vous vous demandez peut-être pourquoi ne pas simplement changer la couleur ? Vous essayez donc avec de l'orange, mais en revenant aux niveaux de gris, le problème persiste. C'est parce que la valeur de la couleur est trop similaire à celle de l'arrière-plan ; la luminosité est trop proche. Vos éléments de premier plan doivent avoir une luminosité distincte, pas seulement une couleur différente. Si vous voulez utiliser de l'orange, c'est possible, mais assurez-vous que sa valeur de luminosité est différente. Essayons à nouveau. C'est un peu mieux, mais vous pouvez basculer entre le noir et blanc pour vérifier que votre figure présente un contraste suffisant. Cela fera toute la différence lorsque votre relecteur examinera votre figure et pourra enfin en saisir les informations. Voici un autre exemple classique : des noyaux cellulaires qui restent sombres. Tout ce que vous superposez sur ces noyaux disparaîtra si la valeur de couleur est trop proche. C'est là que l'astuce des niveaux de gris est utile. Dans le monde des beaux-arts, on a tendance à plisser les yeux pour voir si la figure reste lisible. Parfois, je dézoome sur mon canevas BioRender. Si vous ne voyez rien à cette échelle, il est probable que votre lecteur ne verra rien non plus. C'est une astuce que j'aime utiliser. J'utilise la molette de ma souris pour zoomer et dézoomer. Vous pouvez aussi utiliser les outils de réinitialisation du zoom ou le curseur. Si votre figure doit être affichée en petit format, il est judicieux de dézoomer pour voir ce qu'il en reste.

Dans ce cas, que pourrions-nous faire ? Probablement éclaircir la couleur des cellules pour que les éléments au premier plan soient plus nets. On passe d'un aspect sombre à un rendu bien contrasté. Ou, plus délicat, vous pouvez rendre les éléments du premier plan beaucoup plus clairs. C'est une approche plus risquée, mais qui fonctionne parfois. Voyez-vous comme j'ai éclairci l'ADN ? J'ai toujours des problèmes avec ces molécules orange, donc je reviendrais en arrière pour leur donner une couleur plus marquée par rapport à l'arrière-plan.

Voilà pour la prévisualisation en niveaux de gris afin de vérifier les problèmes de contraste. Si vous ne devez retenir qu'une seule astuce de design aujourd'hui, c'est celle-là. Gardez-la bien en tête. Les derniers conseils concernent les transparences et le contenu adapté à l'audience. Je vais regrouper ces deux points dans les exemples suivants.

Transparence 

J'aime montrer cet exemple car il contient beaucoup d'informations, mais je soupçonne que vos relecteurs de subventions, aussi experts soient-ils, connaissent déjà les éléments canoniques ou universels. Il n'est pas nécessaire d'insister lourdement sur le fait qu'il s'agit de poumons, par exemple ; tout le monde en conviendra, c'est un fait établi. Dans ce cas, vous pouvez réduire la transparence de ces éléments pour mettre davantage en évidence la trachée et les bronchioles, car vous n'avez pas besoin de leur crier qu'il s'agit de poumons.

Même chose pour la trachée. Vous pouvez réduire l'opacité. Voyez-vous comme les ganglions lymphatiques deviennent beaucoup plus visibles lorsque je joue sur la transparence ? Les ganglions ressortent bien mieux qu'avant. Encore une fois, il n'est pas nécessaire d'enseigner aux lecteurs ce qu'est une trachée ou un poumon ; ils sont là pour le contexte anatomique. Même chose pour le foie : je ne vois pas bien cette tumeur métastatique car le foie est trop sombre. N'ayez pas peur d'utiliser le curseur de transparence.

Une autre méthode consiste à utiliser uniquement le contour des organes, ce qui fonctionne assez bien ici. C'était simple, n'est-ce pas ? Il suffit de jouer avec l'opacité des objets superposés pour que votre message principal ressorte. L'attention se porte désormais sur la tumeur : trois centimètres, deux à cinq, cinq à sept, et plus de sept. Je parie que cela ne sautait pas aux yeux quand les poumons étaient en opacité totale. C'était une autre astuce rapide. Je vais passer rapidement en revue, dans les cinq dernières minutes, quelques exemples qui ont été courageusement proposés, et nous verrons comment appliquer ces conseils pour les améliorer.

J'ai adoré cette proposition/figure car le texte était très bien aligné. Il y avait une certaine coordination des couleurs : tout ce qui concernait les régulateurs de l'activité de PRMT5 était codé en bleu, et de même pour le vert. Ce que notre équipe a fait pour améliorer cette figure, c'est de réduire le nombre de couleurs utilisées. Voici l'après, et voici l'avant. La différence est subtile, mais nous n'avions pas besoin d'autant de couleurs, ni d'un arrière-plan aussi marqué. Le noyau n'avait pas besoin d'être violet. En pensant à l'audience, ils n'ont probablement pas besoin de savoir qu'il s'agit d'une bicouche phospholipidique ; la plupart des relecteurs savent qu'il s'agit d'une membrane cellulaire. Nous avons donc opté pour une iconographie plus fluide, à double ligne, ce qui a immédiatement épuré la composition. Tout n'a pas besoin d'être dans une boîte. Je sais que nous sommes tentés de tout encadrer, mais cela peut jouer contre vous. Nous avons supprimé ce cadre, et je trouve que l'ensemble est plus cohérent. Il y aurait peut-être quelques ajustements mineurs à faire, mais dans l'ensemble, le résultat est bien meilleur. Qu'en pensez-vous ?

Adapté à l'audience

Voici un autre exemple, un processus cellulaire un peu plus complexe. Si je plisse les yeux, je vois du rose, une membrane orange vif, un intérieur jaune avec des éléments, et ces petits éléments verts sur le côté qui ressortent beaucoup. En tant que relecteur, je n'ai pas besoin qu'on me crie qu'il s'agit du contour de la cellule. Cela pourrait être beaucoup plus discret pour laisser le focus sur ce qui se passe à l'intérieur. C'est ce que nous avons fait. Voici l'avant et l'après. Nous avons réduit l'intensité du contour de la cellule. Nous avons également agrandi la cellule T auxiliaire, car l'échelle n'était pas vraiment exacte. Nous ne pouvons pas toujours être précis, ces protéines ne sont pas si grandes en réalité, mais nous essayons de garder un rapport un-pour-un autant que possible. L'attention se porte désormais sur ce qui se passe à l'intérieur de la cellule, ainsi que sur les entrées et sorties du processus. Nous avons réduit le nombre de couleurs et pensé à l'audience : ils n'ont pas besoin de voir le contour de la cellule avec autant d'insistance. Nous avons atténué cela pour réserver les touches de couleur aux flèches et aux vésicules.

Vous voyez la différence. Le contenu est identique, il a juste fallu quelques ajustements. Prenez une heure pour appliquer ces conseils, et je suis certain que votre figure sera beaucoup plus claire.

Dernières figures : en voici une autre que j'ai trouvée très bien, avec une division claire en trois catégories. Nous l'avons un peu épurée. Je vois deux processus ici, que nous avons pu condenser en un seul. Voici l'avant et l'après, où une cellule mène à deux résultats. C'était une approche plus propre. Nous avons ajouté ces lignes pointillées pour mieux séparer les trois mécanismes, afin d'éviter que quelqu'un ne pense qu'ils sont tous liés, ce qui pourrait arriver. En fait, ils étaient distincts. Nous avons donc créé une séparation entre les trois et mis en évidence certains éléments qui manquaient de contraste. Avec notre vérificateur de niveaux de gris, ce petit X sur la protéine n'était pas très visible. En le mettant en évidence, il devient frappant que cela ne se lie pas ici ou qu'il n'y a pas d'interaction. C'est beaucoup plus clair ainsi. Les niveaux de gris sont vraiment vos meilleurs alliés pour vérifier la lisibilité.

Nous avons déjà parlé de cet exemple : réduire le nombre de couleurs, la directionnalité de la lisibilité. Pour conclure, la raison pour laquelle je pense que BioRender est si efficace pour créer des figures pour vos demandes de subventions, c'est l'uniformité qu'il apporte.

Je vois beaucoup de scientifiques qui nous demandent comment rendre leurs figures plus uniformes. Vous avez sûrement déjà été dans cette situation : mélanger des photographies, des données réelles, des graphiques issus de GraphPad Prism, des icônes BioRender... On se retrouve avec un mélange de modes de visualisation : photos, dessins à la main, vieux objets graphiques découpés et importés.

Pour éviter cela, j'essaie toujours de garder une cohérence, comme si un seul artiste avait dessiné l'ensemble. C'est généralement possible dans BioRender. Voici l'avant et l'après, où nous avons utilisé uniquement des images vectorielles. Nous avons trouvé cette machine dans BioRender, je crois qu'elle s'appelle "7100, capillaire". Si vous parcourez notre bibliothèque d'icônes, vous verrez que nous avons une immense variété de machines magnifiques. Elles sont toutes dessinées en interne par nos illustrateurs professionnels et sont basées sur des vecteurs. Peu importe les objets que vous importez, ils auront l'air d'avoir été créés par le même artiste, même s'il s'agit de concepts disparates. Ils partagent tous ce style vectorisé très esthétique.

Autant que possible, essayez de garder un style cohérent, surtout si vous avez des processus par étapes ou des flux expérimentaux. Vous ne voulez pas que cela ressemble à un assemblage hétéroclite de sources diverses.

J'adore ce tweet qui soulignait que, pour un article ou une demande de subvention, les auteurs pensent souvent : "Je ferai les figures à la fin", alors que les relecteurs se disent : "Je regarderai les figures en premier". C'est naturel, car si vous tombez sur quelque chose comme ça, nos yeux voudront naturellement se concentrer sur ce qui est le plus facile à lire, c'est-à-dire l'image.

Encore une fois, je vous recommande vivement de commencer tôt. La question du moment idéal pour débuter votre figure revient souvent. J'ai commencé le plus tôt possible, en itérant et en recueillant des retours, exactement comme vous le feriez pour la rédaction de votre demande de subvention.