BioRender 特别课程 101 - 快速上手 BioRender 最新功能！

概览

希望大家准备好迎接充满设计技巧和新功能演示的精彩一天。首先由 Jacqueline McCoskey 为我们带来 BioRender 101 特别版。我有幸与 Jacqueline 共事，她是 BioRender 业务开发团队的客户经理。她总是能以极佳的状态和感染力十足的活力投入到网络研讨会中。加入 BioRender 之前，她曾在多伦多大学的一个实验室工作，研究与运动相关脑震荡相关的各种结果。话不多说，Jacqueline，接下来交给你。

太棒了，谢谢 Jeff。大家能听清我说话吗？非常感谢大家的参与，也感谢你的精彩介绍。为了让大家了解我们今天将要涵盖的内容，我们计划从基础知识开始，然后深入探讨一些高级功能。无论你是 BioRender 的新手还是老手，我们都确保你今天能有所收获，学到一些酷炫有趣的内容。

再次重申我们今天的内容：我们将简要介绍平台本身，确保大家了解界面和操作环境。我们将搜索图标库，这里有海量的图标，非常有趣。我们将介绍不同类型的图标。接着，我们将演示新推出的幻灯片功能以及备受期待的 PDB 上传功能。最后，我们将分享一些实用的设计技巧，教你如何利用渐变让你的故事更具冲击力。

好了，现在我们开始吧。幻灯片功能最酷的地方在于，刚才的开场演示就是用它完成的。这意味着你可以在 BioRender 应用内完成所有工作，直接在屏幕上进行演示。

回到图库视图，再次带大家熟悉一下界面。这是你登录 BioRender 后的主页。你创建的所有图像都会保存在底部的图库中。可以看到我这里有很多不同类型的图像。我算不上特别有条理，但幸运的是，如果你喜欢整理，我们的团队在左侧创建了不同类型的文件夹，让操作变得非常简单。你创建的所有图像都会保存在上方，而与你共享的文件则会显示在下方。

关于这一点，Polly 将在下午 1 点的后续教程中进行深入讲解，大家可以先留意一下。

这些功能旨在帮助你保持条理。根据你正在进行的项目，基本上有两种创建图表的方式。我会带大家了解这两种方式，但我个人喜欢从模板开始。点击模板库，你会看到我们有海量的模板。这些模板每天都在更新，而且由于它们是由数百个 BioRender 图标组成的，因此可以完全编辑和自定义。最棒的是，这些模板全部由我们的内部科学设计团队创作。他们几乎都有科学背景或博士学位，他们将这些图标组合在一起，不仅确保美观，更确保科学准确性。这经过了严格的流程，如果你感兴趣，强烈建议参加下午 2 点 Jerry 和 Vikki 的课程，了解这些模板是如何发布的。

如你所见，我们有各种类型的模板。它们都经过了分类，如果你正在处理通路、细胞间相互作用等内容，都能轻松找到。在更大尺度上，点击“解剖与临床”，你可以看到器官、人体等更大规模的素材。它们也支持搜索。例如，搜索“免疫学”，我们就会列出所有标记为免疫学的模板。

回到主图库，我来演示一下从零开始创建图表的基础步骤。点击这个蓝色大按钮，就会进入画布视图。

这就是我们的画布。基本上，你拖入画布的所有内容都会出现在最终图表中。灰色区域是工作区，允许你放置一些暂时不用的素材。最终图表仅包含白色区域内的内容。

右下角有一个键盘图标。点击它，你可以查看所有快捷键。今天我尽量少用快捷键，但如果你想成为 BioRender 高手，它们是非常好的资源。它们能让你操作极其迅速。这些快捷键与其他软件类似，比如 Mac 上的 Control+C 和 Control+V，但我们也有一些特色快捷键，欢迎查看。

这里还有帮助按钮。如果你在使用过程中有任何疑问，随时点击它，它会带你进入我们的帮助中心。

如果有具体问题或故障，我们的实时支持团队非常出色。根据你所在的位置，他们通常会在一两分钟内回复。我们的代理遍布全球，回复非常及时。他们是解决问题的专家，所以如果需要帮助，请务必利用这个资源。

右侧是更多基础功能。你可以进行缩放，添加或移除标尺，如果对齐对你很重要，还可以添加或移除网格线。顶部是幻灯片功能，就是我之前提到的。这是在 BioRender 内进行演示的方式。对于多画布工作流来说，这也是一种非常棒的方式。如果你正在处理与之前类似的内容，就不必每次都重新创建图像。这是评论按钮，属于我们新的实时协作功能。如果你正在与他人实时协作，他们可以在图表上添加评论。Polly 将在下午 1 点的课程中再次提到这一点，欢迎参加。

左侧是上下文工具栏。这些是类似 PowerPoint 的基础功能。如果你想更改画布颜色或大小，或者添加线条、形状、文本，都在这里操作。此外，根据你选中的画布内容，这里还会出现一组额外的按钮，稍后我会演示。基本上，这允许你对画布上的内容进行操作，使其更符合你的个性化需求。

左侧是内容工具栏，这是你在 BioRender 中花费时间最多的地方。它包含了从图标、画笔到上传文件的所有内容，是 BioRender 的核心所在。

我先来展示一下图标库。我们有成千上万种不同类型的图标，它们和模板一样经过了分类。进入“细胞类型”，再进入“免疫和血液细胞”，这里可以轻松浏览。我总是觉得查看有哪些可用素材很有趣，你也可以直接搜索。为了展示库中素材的丰富程度，我们从微观尺度开始，搜索“抗体”。

你会看到我们有海量的抗体——超过 100 种——它们各不相同，但搜索后都能找到。或者，如果搜索“神经元”，你会发现，谁能想到有这么多类型的神经元呢？我们拥有所有这些不同类型的神经元，并根据你的研究需求提供了不同的功能选项。

假设您正在研究动物模型。我搜索一下“小鼠”，我们有海量的动物素材。如果您正在研究模式生物，我们的图库非常丰富。您可以看到，我们有各种朝向的小鼠，有的带有不同器官，有的只有头部，有的则是全身。无论您需要哪种朝向，我们很可能都能满足您的需求。

再从宏观一点的角度来看，比如搜索“肝脏”。如您所见，我们有健康的肝脏、病变状态的肝脏，还有带有胆囊的肝脏，甚至还有包含肝脏的患者模型。因此，我非常鼓励大家，只要有任何好奇的内容，直接搜索看看我们是否有。我们的图库非常庞大，浏览起来也很有趣。

您可能想知道这些不同类型的图标有什么区别。您会看到左侧带有紫色边框的图标。这就引出了我的下一个要点。我们基本上有三种类型的图标，我先从简单的开始。比如搜索“癌症”。我先从最简单的图标类型开始，在图标库中，这类图标外围没有边框。当您将鼠标悬停在上面时，它就是最基础、最简单的样式。

我把它拖出来。如您所见，非常简单。只需拖放即可将其放置到画布上。现在，我回到搜索栏再次搜索“癌细胞”。这次您会看到，例如这个图标，左下角有一个紫色小方块。当您悬停在上面时，也会出现另一个紫色方块。我将其拖放到画布上，这就是我们所说的“组合图标”。

为了说明一下，我们有外围蓝色边框的简单图标，以及外围紫色边框的组合图标。蓝色边框的简单图标就像 BioRender 的“乐高积木”，是基础组件。您可以更改其颜色，只需使用左侧的编辑选项卡即可。您还可以更改其透明度。这些功能位于顶部，但大多数情况下，这种图标的样式是固定的。

虽然它的可编辑性较低，但我们仍然提供了多种自定义方式。我们的组合图标实际上是由多个较小的子图标构成的。它将通常一起使用的图标组合在一起，这样您就可以点击进入并单独编辑这些部分。如果您想剪切、更改特定部分的颜色，或者想删除其中一个癌细胞，都可以实现。这样做的目的是为了省去您的繁琐工作，因为我们预先将经常搭配使用的元素组合在了一起。当然，它依然具备高度的可定制性。

我们还有第三种图标。我搜索一下“DNA”，左侧会显示一个画笔图标，这就是我们的“画笔”工具。画笔工具非常棒，我特别喜欢，用起来很有趣。我将其拖放到画布上，它们就像画笔一样工作。如果我从这一侧拖动，它会增加螺旋结构，而不是拉伸现有的螺旋，因此您可以根据需要将其做得尽可能大或长。点击它时，您会看到一些节点，这些节点让它更具可定制性，我可以根据工作内容创建出非常独特且酷炫的形状。一切都可以随心调整。

您还可以更改画笔图标的颜色。点击这里，颜色就会改变。我把它拖到顶部，我们还有各种各样的画笔。如果我点击左侧的画笔选项卡，这里就是所有可以根据您的工作进行使用、编辑和修改的画笔。我来展示一下其中的几个。我知道我个人曾经花了很多时间……

过去我花了很多时间在 PowerPoint 里复制粘贴线条和圆圈来制作磷脂双分子层。但在这里，一切都变得如此简单。只需拖出来即可。同样，您可以制作出非常有趣且自定义的形状。就是这么简单。我们把它移到这里。

回到画笔工具，您还可以看到我们有圆形画笔。我们用这个试试，把它拖放进来，顺便把刚才那些删掉。这些画笔的工作原理和节点一样。您只需点击这些小节点，它们是针对每个部分单独设置的。它会在上面切出小口，这样您就可以更改这一部分的颜色，同时保持 360 度的圆环形状。这对于循环类型的图示非常重要。

画笔工具的可编辑性更高。我调入这个肠上皮细胞画笔。我喜欢用这个。我们把它拖放进来，这是一个展示“幻灯片”功能的绝佳方式。我来演示一下如何利用幻灯片功能制作动态效果。我把它拖出来并放大一点。您还可以更改这些小细胞的大小。如果我操作失误，按 Ctrl+Z 撤销即可。我把它拖下来，然后点击顶部画笔选项中的“将画笔拆分为可编辑图标”。点击这里，将其拆分，现在它就变成了我之前展示的那种组合图标，您可以点击进入并更改每一个独立的部分。如果我想更改画笔的整体颜色，也可以做到，但我现在先保持原样。

回到这里。好吧，如果可以的话，我们保持这个棕色。我添加一张幻灯片，点击幻灯片部分，选择“复制幻灯片”。现在，在第二张幻灯片上，我可以进入并更改这些独立的部分。我可以选中其中几个，把它们改成红色，用来展示细胞内部发生的某种损伤。现在，我再次复制这一张，在第三张幻灯片上展示更多的损伤。

我把这一块拉出来，再把这一块拉出来，然后选中它们。如果我点击“更多”，还有各种选项，我可以展示一些非常好的状态，或者展示某些地方出了问题。

现在，回到第一张幻灯片并点击“演示”，我就可以点击切换，展示损伤随过程发展的变化。这是使用 BioRender 进行演示的绝佳方式，能够利用多层级画布真的非常棒。

如果我不想回到主页，而是想添加另一张幻灯片，我也可以这样做，并向您展示其他功能。我想展示的另一个功能是我们的 PDB 扩展。点击这个 PDB 文件，以前任何在蛋白质数据库（Protein Data Bank）中的内容，您都可以在 BioRender 中访问。点击“PDB 检索”并输入 PDB ID，比如我熟悉的 1HZH，然后加载我的蛋白质。它会带我进入另一个视图。加载可能需要一点时间，在这里您可以看到完整的蛋白质结构出现在画布上。您还可以更改其结构。比如，我想把它改成这种快速表面样式，或者范德华力样式。我知道这个看起来很酷。您还可以更改颜色，比如选择“疏水性”。您可以调整许多不同的功能，但我喜欢这个“微调”功能，它让效果看起来非常好。保存为新图标后，它就会被存入我的 BioRender PDB 库中。现在我只需将其拖放到画布上，它就像其他所有图标一样工作。

这是以前的操作方式，但我们有一个非常新颖且令人兴奋的功能，这是用户一直要求的：上传您自己的文件。如果蛋白质尚未在蛋白质数据库中发布，只需点击 PDB，您就可以上传自己的文件。点击“PDB 上传”，只要是支持的文件格式，您就可以直接拖入或下载。我下载这个保存好的 PDB 文件，打开它，给它起个名字，然后加载我的蛋白质。加载需要一点时间，好了。非常简单，非常容易。您可以创建自己的蛋白质，如果它不在蛋白质数据库中，现在您也有能力上传这些功能。

这些特定的蛋白质以同样的方式工作，您可以更改其结构和颜色。我们保存一下！换一种样式，我觉得这个很酷，保存为新图标。同样，它就像其他图标一样，拖放即可使用。这就是我们新推出的令人兴奋的功能之一。

我还想向您展示一件事：回到我的图库。我想带您了解一下渐变功能，因为这是展示某种光谱的绝佳方式。我觉得很多人不知道如何在 BioRender 中使用它，但其实非常简单。我点击“可视化”文件夹——这是我试图保持条理的方式——打开我们的渐变素材。

如果您想展示某种光谱，比如 pH 值刻度、可见光或类似的东西，或者某种扩散模式，这都是非常好的方式。如您所见，左侧是高浓度，右侧是低浓度。但我认为，如果能展示出左侧更深、右侧更浅的效果，看起来会更好。

操作方法是：点击图像，选中这个框，它会高亮显示形状。然后转到“填充颜色”选项。如您所见，它目前填充的是纯色。我点击“渐变”。您可以看到这是框内的纯色。现在我想让它与白色混合，点击这里，如您所见，渐变效果已经添加好了。

但这看起来不是我想要的效果。现在的渐变效果像是顶部浓度高、底部浓度低。要修正这个问题，你可以点击右上角的小角度按钮，我把它设为 270 度——现在，右侧就呈现出了从深到浅的正确渐变效果。

如果你想手动调整，可以这样做。我们底部还提供了多种预设，非常实用。我本来可以像这样简单操作一下，效果就出来了。

人们还喜欢在其他地方展示渐变效果，比如我想找一个离心管，并展示某种浓度变化。就用这个吧，我知道它的可编辑性很高。点击进入，删掉红色部分，但我希望它呈现从浅到深的渐变，以显示底部浓度更高。同样，点击顶部的纯色填充，选择渐变，添加白色，但这也不是我想要的方向，所以我们把它切换到 180 度，这就成了。操作非常简单，也很有趣，能让作品看起来非常专业。

人们通常还有最后一种用法，其实用法有很多种，但这是在图表中增加深度感的另一种简单方法。看看我的幻灯片，切换到第二张。如果你想在孔板中展示移液时的深度感，也可以这样做。哦，我想把这个锁定，锁定对象，然后选中这些孔。让我看看，解锁，有时候这些操作会出点小问题。好了，现在所有孔都选中了，可以看到它们是纯色的。回到顶部，再次点击填充颜色，选择渐变，在底部添加这个白色效果，但这也不是我想要的渐变，我可以点击这个圆形渐变，很酷，它能显示出孔板内特定的深度感。这是一种既简单又有趣的方法，能让你的作品看起来非常专业。

以上就是 BioRender 的基础知识，以及一些进阶技巧。如果你想继续参加大约五分钟后开始的下一场会议，Francesca 将会分享一些非常棒的技巧和窍门，以及我们的一些新功能，确保大家在会议结束时都能成为 BioRender 的专家。

好了，Jeff 准备好后，我就把话筒交给他。再次感谢大家的参与，非常感谢。