BioRender 201 - 新功能与进阶技巧！

概览

大家好。正如 Jeff 所介绍的，我叫 Francesca。我将基于 Jacqueline 之前提到的概念，带大家深入了解一些我们更新、更进阶的功能。

今天我们将涵盖的内容，我将其归纳为四个主要功能，我认为这些功能在自定义设置或节省时间方面非常实用。前两个是 多选和对齐工具 ，我将与大家逐一演示。后两个是关于以下内容的自定义工具： 形状和线条。此外，我还将介绍两个新功能： 连接线和自定义图标颜色，我也非常期待向大家展示这些功能。

好了，让我们深入了解这些进阶功能。首先，我将演示如何利用我们的多选和对齐工具来节省时间。

多选 

如果您在环境中需要处理大量相同元素（无论是细胞因子、抗体，甚至是溶液中的细胞），这个功能真的能为您节省大量时间。假设您想一次性编辑所有这些抗体，而不是像这样逐个选中它们再更改颜色——如果您想把所有抗体都改成红色或紫色，我们有一个非常棒的功能。我来演示一下：只需右键点击其中一个图标，然后选择“选择所有相同图标”（select all the same icons），这会自动选中画布上所有同类型的图标，以便您统一进行编辑和修改。所以，如果我想把它们改成红色或紫色，直接操作即可，无需逐个修改。稍后我会演示更详细的操作，但在这种情况下，您可能已经选中了所有图标并统一进行了更改，不过在某些特定场景下，这个功能真的非常实用。

例如在肿瘤微环境的场景中，您可能有很多免疫细胞和癌细胞混在一起，如果逐个修改这些癌细胞简直是场噩梦。我们已经为您解决了这个问题：再次右键点击，选择“选择所有相同图标”，它甚至会选中图例中的图标，即覆盖整个画布，然后您就可以像这样统一进行更改了。

在为这些图像选择颜色时，我也会顺便分享一些设计技巧。例如，在这张图中，我们的癌细胞是绿色的，免疫细胞是红色的。回想一下，小时候读故事书或漫画时，如果故事中有明显的反派和正派，通常反派会呈现出红色调。即使在这张达斯·维达与卢克·天行者对决的图中，您也可以看到他们的光剑也是红绿对比。这些概念在叙事中被广泛应用，您也可以将其运用到科学图表中。通常，正派角色更倾向于使用冷色调，如绿色或蓝色。

这里还有一些我们童年时期最爱角色的例子。迪士尼和皮克斯经常利用色彩概念来含蓄地讲述故事。您可以看到，红色通常代表危险和邪恶。回到我们这张肿瘤微环境的图，考虑到这一点，我们可以看出癌细胞显然是“反派”，所以我打算把它从绿色改成红色调。我们这里有几个选项，暂时先用这个。而这些免疫细胞，仅从颜色上看显得有些可怕。但实际上，免疫细胞和树突状细胞对人体非常有益，所以我打算把它们改成绿色。至于这些巨噬细胞，我可能会把它们改成蓝色。

就这样，无需更改任何文字或构图，仅通过色彩调整，您就能看出这张肿瘤微环境图中叙事逻辑变得更加清晰了。这就是使用该功能的一种方式，同时也请记住这些色彩运用的概念。

接下来我想谈谈这类图表。我很喜欢这个实验流程的布局，它组织得非常整齐。但我这里有一个重点蛋白质，我希望读者能特别关注它。然而，由于它是蓝色的，而图中许多其他图标也是蓝色的，它显得有些不突出。所以我打算再次使用“选择所有相同图标”功能。

它会选中所有相关图标以及所有放大框中的内容，甚至包括纯化步骤的图标。我们把它改成橙色怎么样？我选择橙色是因为它是蓝色的互补色。回想一下小时候学习的色轮，所谓互补色，就是指色轮上处于相对位置的颜色。比如红与绿、蓝与橙、紫与黄。当这些颜色并置时，会产生强烈的对比，使其中一个元素更加突出。这就是我选择在蓝色背景下使用橙色的原因。

我发现很多公司在设计 Logo 时也会这样做，因为他们希望 Logo 醒目。您可以看到蓝配橙、红配绿，或者黄配紫。这些都是现实生活中的例子，您可以借鉴它们，让您的图像（无论是重点蛋白质还是 DNA 片段）更加醒目突出。希望这部分内容讲清楚了。如果您有任何问题，请随时告诉我。我屏幕右侧的聊天窗口是打开的，如果有其他问题，欢迎提出，我很乐意为您解答。

对齐 

除了节省配色时间，此功能在对齐工具方面也能提供很大帮助。如果你的画布上像这样散落着许多细胞，不必一个个手动对齐，只需右键点击并选择所有相同的图标，然后使用顶部工具栏中非常实用的对齐功能即可。你可以选择“均匀分布”让细胞间距一致，再选择“居中对齐”，只需两步，几秒钟内就能让它们排列得整整齐齐。这对我来说是一个非常节省时间的功能。虽然这里只有五个血细胞，但如果你在处理实验方案等包含大量图标的情况，甚至是一些方框，就不需要再费力地一个像素一个像素地去调整了。只需选中所有对象，重复刚才提到的分布和对齐操作，就能轻松搞定。这就是我想要分享的高级功能之一，希望大家理解，如果有什么问题请随时提出，接下来我们将进入下一个环节。

下一个技巧是关于自定义的。BioRender 提供了许多自定义工具，比如形状和线条。我知道聊天区里也有人问到这个问题，我现在就来解答。首先我想介绍一个我们内部称为“自定义斑点工具”（custom blob tool）的功能。我不确定它是否有正式名称，但我们就暂且这么叫它。虽然名字听起来有点滑稽，但这些自定义工具的使用逻辑非常相似，我只演示其中一个。这些工具非常强大，特别适合那些像我一样手绘不够稳的人。我见过我们的插画师徒手绘制一切，但我自己做不到，所以我经常用这个工具来拖拽出我需要的任何自定义形状。

在这里，你可以看到许多不同的节点。其中一些是蓝色填充的，代表现有的锚点；另一些是白色的，你可以拖动它们来创建新的锚点。每拖动一次，就会出现一个新的节点，你可以无限地进行编辑，创建出任何你需要的形状，无论是像果冻豆一样的形状还是不规则的涂鸦。此外，你还可以进一步编辑和自定义边框与填充，这与 Jacqueline 之前介绍的“Bio-brushes”类似，但它是针对形状的。你可能在想这个工具能用在哪里。它看起来确实有点奇怪，但实际上在很多地方都能派上用场。它不仅适用于大脑，还可以用于胚胎、肝脏或任何其他图标类型，当你想要突出显示这些图标的特定区域时，就可以使用它。让我来演示一下。

自定义形状

我个人喜欢用大脑图标，因为它具有非常明显的叶状结构，非常适合演示。如果现场有神经科学家，我想你们也会认同这一点。如果你想突出显示图标的某个部位，比如大脑中的病变区域，或者影响范围较大的肿瘤，甚至是活性位点——比如你施用了某种药物，发现大脑额叶比后叶更活跃，并想展示这一点——你都可以轻松使用这个工具来实现。我可以放大细节，通过增加更多节点来精确地勾勒出各个脑叶。为了节省时间，演示中我就不做得那么细致了，大家可以自己去尝试一下。

除了直接添加斑点，我还会调整它的颜色。我喜欢使用颜色预设，虽然你可以使用填充颜色工具从调色板中选择任意颜色，但我个人更倾向于预设，因为这样更快，而且我们的插画师已经花了很多时间来确保色彩对比度和搭配效果。现在，我将调整一下画布，降低填充内部的透明度，让它看起来更清晰。也许我会把它调成红色，并进一步降低透明度，这样你就能透过斑点看到下方大脑的背景。这样既能突出显示该区域，又不会遮挡住原本的图像。

这是大脑的结构。如果我想添加一个肿瘤，只需输入“tumor”，像 Jacqueline 之前提到的那样，添加一个标准图标，调整一下大小即可。无论是肿瘤，还是神经元，你都可以随心添加。比如，我们想添加一些神经通路。这些工具非常酷且易于使用，让我来演示一下。这个神经元图标的操作逻辑与其他节点类似，你可以拖动它，新的白色节点就会出现，你可以不断拖动来创建非常详细的路径。接着，我再添加一个神经元，并使用这个小按钮将其翻转，这样它们就是尾对头连接，而不是头对头了。就这样，几秒钟内我就创建出了大脑结构，标出了活跃区域，并添加了相应的神经通路。顺便提一下，我们所有的箭头都在“插入线条”下，无论是线条还是神经元，操作方式都非常相似，都可以通过拖动节点来调整。刚才有人问到如何改变线条宽度，这当然也是可以做到的。在介绍这些神经元和自定义工具时，我想顺便提一下这一点。

很棒，现在我们有了大脑和斑点工具。这只是一个用例，另一个用例是制作你自己的蛋白质。它看起来像个果冻豆或小腰豆，但如果你在上面加上 DNA，它就变成了一个蛋白质，甚至是一个 CRISPR 蛋白。假设你对蛋白质进行了突变，使其凹陷处变得更深，你就可以使用斑点工具来调整它。无论你是想让它变得更凹，还是进行其他修改，都可以通过这个工具来实现。这是利用这个形状工具来讲述你的科学故事的另一个例子。

这里还有几个我想强调的用例。我们的一些插画师之前做过类似的设计，看起来非常复杂，但本质上就是大脑干和大脑横截面，我记得是基底神经节，所有这些都是通过我刚才展示的那些可以编辑和拖动节点的工具完成的。

自定义线条

下一个我想重点介绍的功能是圆形箭头，因为我看到很多人在 BioRender 中制作循环图，我觉得这是一个被低估的功能。这是我最喜欢的功能之一。让我把它放大一点，这样你看得更清楚。本质上，它就是一个完整的圆形箭头，而且会自动对齐。你可以将光标悬停在白色节点上，当它变成剪刀图标时，你就可以在不同位置进行切割并拖动，这对于制作循环图非常有用。另一个例子是质粒图谱，如果你需要制作基因图谱，这个功能也非常棒。我来快速演示一下。我们可以加粗线条，添加箭头。通常质粒图谱的箭头头部较小，所以我把它缩小。我可以把它切成不同的部分来表示基因 A、基因 B 和基因 C，并调整大小。这个工具可能需要一点时间来适应，但我保证一旦上手，就非常简单。现在我们有了质粒图谱。顺便提个建议：如果你在做标注，让颜色与标签匹配，能极大地帮助观众理解。看这里，我把它调成黄色。我的电脑有点卡，我加快一点速度。只需几秒钟，你就能做出这个基因质粒图谱。你还可以把它放在离心管的背景中。圆形箭头在相位图或项目周期图中也非常有用。本质上，这些都是经过巧妙设计的圆形箭头。比如这些分段的圆形箭头，你可以看到头部被加粗了，而其他部分去掉了箭头。这个项目周期图本质上就是一个被切开的大箭头，周围放上文本框。这些看起来很酷但制作起来似乎很难的图，拆解开来看其实非常简单，就是由几个圆形箭头组合而成的。我看到我们插画师做过一个看起来非常复杂的图，其实就是三个大圆圈。如果你仔细看，能找到三个圆形箭头，中间穿插着图标。所以，很多看起来复杂的流程图，只要掌握了工具，拆解开来添加图标，你就能轻松上手制作。

连接线

如果大家有什么问题，请随时告诉我。看起来大家都觉得很清楚，但我很乐意在最后留出时间回答问题。最后 15 分钟，我想重点介绍两个我精心挑选的新功能，它们同样是为了节省时间和增强自定义能力。第一个是连接线。这是我期待已久的功能，很高兴我们终于推出了。还记得我们刚才介绍的箭头用法吗？我们现在有了新版本的箭头，可以将它们连接在一起。比如我想让箭头从蛋白质 A 指向蛋白质 B，这非常简单。我没想到它还能变得更好，但我们确实做到了。现在，当你将鼠标悬停在任何方框上时，会出现这些节点。我放大一点，你可以看到这个节点变成了蓝色，我可以将一个节点连接到另一个节点，它会自动吸附到位。我可以连接这里，也可以连接那里。我选择连接这里，因为这是我想要做的图表，它指向方框的左侧，所以我将蛋白质 A 的底部连接到蛋白质 B 的左侧。这样，无论我怎么拖动，箭头都会自动跟随。我不需要分别移动箭头和方框，它会自动调整。这真的很酷。如果我想改变位置，只需移动一下，它就会自动弯曲。这就是连接线的工作原理，大大减少了操作步骤。

我还想强调，这些箭头不仅适用于文本框，还可以吸附到我们的图标上。比如这个培养皿，如果我想移动它，以前我得先移动图标，再调整所有箭头，如果移动后觉得不合适还得再调回来。现在有了连接线，只需移动主体，箭头就会自动跟随，这对于流程图、实验方案等工作流非常有用。

这里有一个设计小贴士：在制作包含大量箭头的复杂图表时，尽量减少从方框延伸出的角度。例如，与其让标签到标签之间有复杂的折线，不如直接使用直角。如果我想移动它并改成直角，以前我必须手动调整箭头，而现在如果使用了连接线，我只需移动方框，箭头就会自动跟随。这就是最大的区别。我刚才把左侧设为未连接，右侧设为已连接。比如，如果你想把所有标签向下移动一点，以前我得分别调整箭头，而现在只需向下拖动标签，箭头会自动跟随，非常方便。

这就是连接线功能，我觉得非常实用。在处理这种路径图时，同样遵循减少分支角度的原则。如果我想把它改成直角，以前我必须一个一个地移动箭头，而现在因为使用了连接线，我可以直接拖动它，轻松改成直角。记住，减少图像中的角度会让图表看起来更简洁。这就是“之前”和“之后”的区别，直角看起来更好。如果你想优化图表，使用连接线会让一切变得更简单。希望这个功能介绍得足够清楚。

自定义颜色

下一个技巧是关于自定义的，这是团队非常期待推出的功能。我也很兴奋，因为我看到观众中也有人提到过这个功能，那就是自定义图标的颜色。以这个秀丽隐杆线虫（C. elegans）为例，进入编辑模式，你们可能习惯了以前那些漂亮的颜色预设，Jacqueline 在之前的环节也介绍过。但现在我们有了“颜色叠加”（color overlay），它提供了几乎无限的颜色选择。让我演示一下，如果我想把线虫变成青绿色，只需拖动色谱条，就能调出任何想要的色调。如果我想使用特定的品牌色，可以直接输入十六进制代码。因为我们现在在 BioRender 的活动现场，我就输入 BioRender 的蓝色代码。这可以是你的公司品牌色，也可以是学校的品牌色，或者仅仅是你最喜欢的颜色。只需点击“颜色叠加”旁边的加号，输入十六进制代码即可。

这里还有几个编辑器选项。你可以调整透明度，以前无法编辑的饱和度现在也可以调整了。如果你想降低饱和度，让颜色看起来不那么浓郁，只需拖动滑块即可。还有一个非常酷的功能是“发光”（glow），我会在下一张幻灯片中重点介绍，它非常适合表现荧光蛋白（GFP）等效果。我还想强调一下这个鼠标图标，我在试用时发现，我们现在可以分别编辑图标的各个部分。比如以前你只能整体改变颜色，但现在你可以分别选择皮肤、毛发和眼睛。这真的很酷！我选择了皮肤部分，如果我想把它从紫色改成绿色，完全没问题。也许我先把它改成粉色，应用一下，是不是很酷？眼睛也是一样，我昨天才发现，如果点击这些图标并选中眼睛，你也可以改变眼睛的颜色，比如改成红色、蓝色或发光的绿色。这真的非常棒。

此外，这是一个我认为非常令人兴奋的自定义功能，你只需在这里选中即可点击所有不同的图层。我想重点介绍一下发光功能，例如，如果你有一个病毒或蛋白质的示例，并且想确保外部结构呈现发光效果，或者它是一个绿色荧光蛋白（GFP）。Poly 实际上也会在接下来的功能中突出显示评论功能，但在这里，举个例子，如果你的首席研究员（PI）说“把这些设为荧光绿”，并给了你一个十六进制颜色代码，我可以直接选中所有这些蛋白质，然后通过在这里输入代码，将它们变成我想要的绿色。我暂时先选这个绿色，然后再稍微调整一下饱和度。如果你进入这个“发光”（glow）选项，就可以让蛋白质呈现发光效果，我觉得这非常酷。无论发光效果在你的图像中是开启还是关闭，你都可以直接在这里进行更改，并调整其强度。我认为这是我们添加的一个很棒的功能，也想借此机会重点介绍一下。

太棒了，最后一个小贴士可能听起来有点老套，但就是记得要乐在其中。我们内部团队在构思这些功能、为你们进行开发，以及与像你们这样的社区成员合作创造这些功能时，都感到非常快乐。所以，我只是想确保每个人都能了解所有这些不同的功能，并希望你们在使用时也能享受其中的乐趣。 

这就是我的最后一个小贴士了。总之，请记得享受过程，在 BioRender 上玩得开心。最后，感谢大家的参与，也感谢你们加入这次会议。